Πληροφορούμενη την απώλεια του Νίκου Εμμ. Παπαδάκη, η Υπουργός Πολιτισμού Λίνα Μενδώνη έκανε την ακόλουθη δήλωση:
«Με πολύ μεγάλη θλίψη πληροφορήθηκα την απώλεια του Νίκου Εμμ. Παπαδάκη, του προσφιλούς μας Παπαδή. Διευθυντής και ψυχή, για πάνω από είκοσι χρόνια, του Εθνικού Ιδρύματος Ερευνών και Μελετών «Ελευθέριος Κ. Βενιζέλος», συνέβαλε, όσο ελάχιστοι, στη μελέτη του έργου και της προσωπικότητας του Βενιζέλου, αλλά και της εποχής του. Από τη θέση του στο Ίδρυμα διέσωσε και κατέστησε προσιτό πολύτιμο αρχειακό υλικό, διοργάνωσε δεκάδες συνέδρια, συντόνισε και στήριξε ερευνητικές δράσεις, δημοσίευσε δεκάδες εκδόσεις υψηλότατου επιστημονικού επιπέδου. Με την ογκώδη και εξαντλητική βιογραφία του Ελευθέριου Βενιζέλου, ένα πραγματικό έργο ζωής, κατέλιπε ένα βιβλίο αναφοράς για το πρόσωπο και την εποχή του Εθνάρχη.
Είχα την τύχη να έχω μαζί του πολυετή γνωριμία και συνεργασία. Να εκτιμήσω το ασίγαστο πάθος του για όλο και περισσότερα εγχειρήματα, που μετατρέπονταν υποδειγματικά σε πράξη, το υψηλό αίσθημα ευθύνης του έναντι του πολίτη, την άκρατη πίστη του στις φιλελεύθερες ιδέες, προσαρμοσμένες στη σύγχρονη πραγματικότητα.
Ο Νίκος Εμμ. Παπαδάκης υπήρξε ένας επίλεκτος πολίτης και ένας αφοσιωμένος φίλος. Στην οικογένειά του, τους πολυάριθμος φίλους και τους συνεργάτες απευθύνω ειλικρινέστατα συλλυπητήρια».
Ο πρόεδρος της Εκτελεστικής Επιτροπής και γενικός διευθυντής του Εθνικού Ιδρύματος Ερευνών και Μελετών «Ελευθέριος Κ. Βενιζέλος» Νίκος Εμμ. Παπαδάκης, έφυγε από τη ζωή «έπειτα από μία άνιση σύντομη μάχη που έδωσε με γενναιότητα» την Παρασκευή 5 Σεπτεμβρίου 2025.
Συγγραφέας, δικηγόρος και αντιπρόεδρος του Ιδρύματος «Αγία Σοφία», ο Νίκος Παπαδάκης άφησε το αποτύπωμά του στην τοπική κοινωνία των Χανίων.
Ως μελετητής της ζωής του Ελευθερίου Βενιζέλου, συνέγραψε μία από τις πιο εμπεριστατωμένες βιογραφίες του, το πόνημά του «Ελευθέριος Βενιζέλος, ο άνθρωπος, ο ηγέτης».
Τακτικός αρθρογράφος και επιμελητής εκδόσεων, συνέβαλε επίσης σε σημαντικές μελέτες για το Κυπριακό, τη Μικρασιατική Εκστρατεία και Καταστροφή και την ιστορία της Κρήτης.
Η κηδεία του θα τελεστεί την Τρίτη 9 Σεπτεμβρίου στις 12 το μεσημέρι στην εκκλησία της Αγίας Μαγδαληνής στη Χαλέπα.
Η σορός του θα βρίσκεται στον ναό από τις 10:30 π.μ. Θα ταφεί στον τόπο καταγωγής του, τον Βάμο Αποκορώνου, όπου προηγουμένως θα τελεστεί τρισάγιο στην εκκλησία του Αγίου Νικολάου. Παράκληση της οικογένειάς του, αντί στεφάνων να ενισχυθούν κοινωφελείς δράσεις.
Οι μουσειακοί χώροι του Ιδρύματος στη Χαλέπα, τις Μουρνιές και το Θέρισο παραμένουν κλειστοί μέχρι και την ημέρα της κηδείας.
